תכנית התואר השלישי בגיאוגרפיה מאפשרת לתלמידים להתמחות בכל תחומי המחקר בחוג:
תכנון וגיאוגרפיה יישומית, גיאוגרפיה פיסית, מערכות מידע גיאוגרפיות וחישה מרחוק, לימודי סביבה ומשאבי טבע, תיירות ופנאי, גיאוגרפיה עירונית וכפרית, גיאוגרפיה וחינוך,גיאוגרפיה פוליטית חברתית ותרבותית, תחבורה ימית ותקשורת,וכן בכל התחומים הקשורים לערביי ישראל.